全てのカードのレアリティにおいて、特に稀少度の高いカードを指す。
WIXOSSの場合はブースターパックごとにシークレット(と、さらに上位のレアリティとして「シークレット中のシークレット」とでも言うべき???)が存在する。
例えばサーブドセレクター(WX01)の場合「全103種+シークレット」のように枚数を明示しない形で表記される(サーブドセレクターの場合、実際のシークレットは9種)。
1BOX中に必ず封入されているわけではない。また、シークレットが封入されているBOXでは通常スーパーレアが1枚少なくなっている。
仕様違いのレアリティであり、カードとしての性能は元々のカードと同じなのでコレクション用のレアリティ以上の意味は無い。
ただし、一部のカードはフレーバーテキストが異なっているためレアリティ上はコモン、レア、ルリグコモン各種に存在するパラレルカードとは別の扱いとなる。
基本的にそのブースターパックに入っているカードの仕様違いだが、元々は構築済みデッキのカードである《満月の巫女 タマヨリヒメ》(ホワイトホープ収録と同イラスト)や《コード・ピルルク》(新規イラスト)などが収録されたこともある。
シグニのシークレットは大半がスーパーレアのパラレル相当で、原則として各クラスごとに1〜3枚の「リーダー格」が存在するが、箔押しサインが入ったものなど例外もある。
チェインドセレクターの時点では、空獣・古代兵器(リーダー格は存在する)・精元のシークレットは登場していない。