全てのカードのレアリティにおいて、特に稀少度の高いカードを指す。
WIXOSSの場合はブースターパックごとにシークレットが存在する。
例えばサーブドセレクター(WX01)の場合「全103種+シークレット」のように枚数を明示しない形で表記される(サーブドセレクターの場合、実際のシークレットは9種)。
仕様違いのレアリティであり、カードとしての性能は元々のカードと同じなのでコレクション用のレアリティ以上の意味は無い。
ただし、一部のカードはフレーバーテキストが異なっているためレアリティ上はコモン、レア、ルリグコモン各種に存在するパラレルカードとは別の扱いとなる。
基本的にそのブースターパックに入っているカードの仕様違いだが、元々は構築済みデッキのカードである《満月の巫女 タマヨリヒメ》(ホワイトホープ収録と同イラスト)や《コード・ピルルク》(新規イラスト)などが収録されたこともある。
シグニのシークレットは大半がスーパーレアのパラレル相当で原則として各クラスごとに1〜2枚の「リーダー格」が存在するが、箔押しサインが入ったものなど例外もある。第4弾の時点では、鉱石・空獣・古代兵器・精元(サーバント?)のシークレットは登場していない。